Protein–RNA interactions for Protein: P23258

TUBG1, Tubulin gamma-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG1P23258 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBG1P23258 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms