Protein–RNA interactions for Protein: P22392

NME2, Nucleoside diphosphate kinase B, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P22392 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NME2P22392 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NME2P22392 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME2P22392 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME2P22392 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME2P22392 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME2P22392 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME2P22392 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME2P22392 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME2P22392 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME2P22392 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME2P22392 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME2P22392 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME2P22392 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME2P22392 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME2P22392 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME2P22392 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME2P22392 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME2P22392 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NME2P22392 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NME2P22392 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME2P22392 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME2P22392 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME2P22392 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME2P22392 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME2P22392 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME2P22392 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME2P22392 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME2P22392 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME2P22392 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME2P22392 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME2P22392 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME2P22392 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME2P22392 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME2P22392 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME2P22392 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NME2P22392 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME2P22392 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME2P22392 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME2P22392 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NME2P22392 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME2P22392 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME2P22392 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME2P22392 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME2P22392 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME2P22392 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME2P22392 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NME2P22392 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME2P22392 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME2P22392 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME2P22392 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NME2P22392 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME2P22392 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME2P22392 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME2P22392 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME2P22392 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME2P22392 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME2P22392 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME2P22392 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME2P22392 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME2P22392 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NME2P22392 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME2P22392 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME2P22392 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME2P22392 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME2P22392 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME2P22392 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME2P22392 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME2P22392 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME2P22392 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME2P22392 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME2P22392 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME2P22392 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME2P22392 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME2P22392 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME2P22392 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NME2P22392 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME2P22392 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME2P22392 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME2P22392 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME2P22392 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME2P22392 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NME2P22392 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME2P22392 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME2P22392 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NME2P22392 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME2P22392 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME2P22392 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME2P22392 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME2P22392 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME2P22392 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME2P22392 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME2P22392 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NME2P22392 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME2P22392 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME2P22392 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME2P22392 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME2P22392 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME2P22392 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME2P22392 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms