Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PCMT1P22061 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCMT1P22061 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCMT1P22061 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCMT1P22061 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCMT1P22061 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCMT1P22061 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCMT1P22061 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCMT1P22061 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCMT1P22061 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PCMT1P22061 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCMT1P22061 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCMT1P22061 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCMT1P22061 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms