Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB5AP20339 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms