Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDCP19113 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDCP19113 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDCP19113 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDCP19113 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDCP19113 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDCP19113 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDCP19113 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HDCP19113 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDCP19113 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDCP19113 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDCP19113 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDCP19113 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDCP19113 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDCP19113 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDCP19113 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDCP19113 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDCP19113 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDCP19113 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDCP19113 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDCP19113 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDCP19113 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDCP19113 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDCP19113 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDCP19113 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDCP19113 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDCP19113 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDCP19113 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDCP19113 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDCP19113 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDCP19113 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDCP19113 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDCP19113 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDCP19113 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDCP19113 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDCP19113 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDCP19113 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDCP19113 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDCP19113 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDCP19113 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDCP19113 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HDCP19113 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDCP19113 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDCP19113 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDCP19113 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDCP19113 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDCP19113 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDCP19113 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDCP19113 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDCP19113 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDCP19113 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDCP19113 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDCP19113 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HDCP19113 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDCP19113 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDCP19113 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDCP19113 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDCP19113 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDCP19113 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDCP19113 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDCP19113 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HDCP19113 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HDCP19113 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HDCP19113 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HDCP19113 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDCP19113 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDCP19113 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDCP19113 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDCP19113 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDCP19113 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDCP19113 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDCP19113 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HDCP19113 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HDCP19113 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDCP19113 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDCP19113 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDCP19113 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDCP19113 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDCP19113 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDCP19113 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDCP19113 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDCP19113 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDCP19113 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDCP19113 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDCP19113 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDCP19113 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HDCP19113 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDCP19113 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDCP19113 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDCP19113 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDCP19113 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDCP19113 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HDCP19113 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDCP19113 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDCP19113 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDCP19113 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDCP19113 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDCP19113 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDCP19113 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDCP19113 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms