Protein–RNA interactions for Protein: P18887

XRCC1, DNA repair protein XRCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC1P18887 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XRCC1P18887 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XRCC1P18887 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XRCC1P18887 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XRCC1P18887 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XRCC1P18887 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XRCC1P18887 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XRCC1P18887 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XRCC1P18887 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XRCC1P18887 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XRCC1P18887 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
XRCC1P18887 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XRCC1P18887 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XRCC1P18887 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XRCC1P18887 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XRCC1P18887 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms