Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DESP17661 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DESP17661 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DESP17661 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DESP17661 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DESP17661 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DESP17661 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DESP17661 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DESP17661 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DESP17661 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DESP17661 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DESP17661 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DESP17661 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DESP17661 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DESP17661 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DESP17661 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DESP17661 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DESP17661 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DESP17661 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DESP17661 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DESP17661 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DESP17661 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DESP17661 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DESP17661 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DESP17661 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DESP17661 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DESP17661 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DESP17661 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DESP17661 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DESP17661 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DESP17661 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DESP17661 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DESP17661 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DESP17661 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DESP17661 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DESP17661 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DESP17661 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DESP17661 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DESP17661 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DESP17661 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DESP17661 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DESP17661 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DESP17661 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DESP17661 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DESP17661 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DESP17661 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DESP17661 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DESP17661 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DESP17661 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DESP17661 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DESP17661 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DESP17661 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DESP17661 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DESP17661 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DESP17661 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DESP17661 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DESP17661 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DESP17661 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DESP17661 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DESP17661 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DESP17661 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DESP17661 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DESP17661 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DESP17661 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DESP17661 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DESP17661 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DESP17661 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DESP17661 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DESP17661 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DESP17661 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DESP17661 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DESP17661 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DESP17661 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DESP17661 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DESP17661 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DESP17661 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DESP17661 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DESP17661 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DESP17661 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DESP17661 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DESP17661 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DESP17661 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DESP17661 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DESP17661 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DESP17661 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DESP17661 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DESP17661 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DESP17661 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DESP17661 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DESP17661 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DESP17661 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DESP17661 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DESP17661 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DESP17661 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DESP17661 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DESP17661 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DESP17661 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DESP17661 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DESP17661 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DESP17661 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms