Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACADSP16219 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACADSP16219 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACADSP16219 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACADSP16219 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACADSP16219 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACADSP16219 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACADSP16219 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACADSP16219 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACADSP16219 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACADSP16219 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACADSP16219 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACADSP16219 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACADSP16219 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ACADSP16219 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ACADSP16219 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACADSP16219 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACADSP16219 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACADSP16219 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACADSP16219 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACADSP16219 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACADSP16219 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACADSP16219 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACADSP16219 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACADSP16219 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACADSP16219 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACADSP16219 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACADSP16219 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACADSP16219 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACADSP16219 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACADSP16219 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACADSP16219 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACADSP16219 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACADSP16219 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACADSP16219 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACADSP16219 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACADSP16219 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACADSP16219 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACADSP16219 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACADSP16219 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACADSP16219 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACADSP16219 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ACADSP16219 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACADSP16219 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACADSP16219 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACADSP16219 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACADSP16219 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACADSP16219 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ACADSP16219 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACADSP16219 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ACADSP16219 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACADSP16219 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACADSP16219 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACADSP16219 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACADSP16219 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACADSP16219 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACADSP16219 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACADSP16219 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACADSP16219 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACADSP16219 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACADSP16219 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACADSP16219 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACADSP16219 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ACADSP16219 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACADSP16219 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACADSP16219 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACADSP16219 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACADSP16219 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACADSP16219 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACADSP16219 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACADSP16219 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACADSP16219 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACADSP16219 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACADSP16219 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACADSP16219 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACADSP16219 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACADSP16219 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACADSP16219 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACADSP16219 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACADSP16219 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACADSP16219 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ACADSP16219 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACADSP16219 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACADSP16219 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACADSP16219 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACADSP16219 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACADSP16219 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACADSP16219 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACADSP16219 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACADSP16219 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACADSP16219 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACADSP16219 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACADSP16219 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACADSP16219 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ACADSP16219 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACADSP16219 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACADSP16219 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACADSP16219 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACADSP16219 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACADSP16219 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms