Protein–RNA interactions for Protein: P15172

MYOD1, Myoblast determination protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOD1P15172 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYOD1P15172 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms