Protein–RNA interactions for Protein: P13987

CD59, CD59 glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD59P13987 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD59P13987 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD59P13987 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD59P13987 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD59P13987 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD59P13987 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD59P13987 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD59P13987 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CD59P13987 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD59P13987 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CD59P13987 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD59P13987 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD59P13987 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD59P13987 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CD59P13987 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD59P13987 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD59P13987 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD59P13987 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD59P13987 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD59P13987 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD59P13987 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD59P13987 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CD59P13987 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CD59P13987 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD59P13987 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD59P13987 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD59P13987 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD59P13987 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD59P13987 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD59P13987 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD59P13987 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD59P13987 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CD59P13987 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD59P13987 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD59P13987 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD59P13987 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD59P13987 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD59P13987 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD59P13987 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD59P13987 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD59P13987 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD59P13987 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD59P13987 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CD59P13987 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD59P13987 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD59P13987 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD59P13987 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD59P13987 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD59P13987 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD59P13987 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD59P13987 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD59P13987 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD59P13987 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD59P13987 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD59P13987 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CD59P13987 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD59P13987 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD59P13987 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD59P13987 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD59P13987 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD59P13987 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD59P13987 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD59P13987 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD59P13987 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CD59P13987 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD59P13987 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD59P13987 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD59P13987 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD59P13987 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD59P13987 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD59P13987 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD59P13987 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD59P13987 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD59P13987 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD59P13987 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD59P13987 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD59P13987 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD59P13987 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD59P13987 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD59P13987 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD59P13987 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD59P13987 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD59P13987 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD59P13987 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD59P13987 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD59P13987 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD59P13987 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD59P13987 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD59P13987 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD59P13987 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD59P13987 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD59P13987 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD59P13987 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CD59P13987 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD59P13987 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD59P13987 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD59P13987 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD59P13987 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD59P13987 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD59P13987 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms