Protein–RNA interactions for Protein: P13637

ATP1A3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A3P13637 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP1A3P13637 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP1A3P13637 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP1A3P13637 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP1A3P13637 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP1A3P13637 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP1A3P13637 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP1A3P13637 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP1A3P13637 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP1A3P13637 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP1A3P13637 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP1A3P13637 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP1A3P13637 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP1A3P13637 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP1A3P13637 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP1A3P13637 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP1A3P13637 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP1A3P13637 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP1A3P13637 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP1A3P13637 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP1A3P13637 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP1A3P13637 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP1A3P13637 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP1A3P13637 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP1A3P13637 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP1A3P13637 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms