Protein–RNA interactions for Protein: P11171

EPB41, Protein 4.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41P11171 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPB41P11171 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPB41P11171 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPB41P11171 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPB41P11171 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPB41P11171 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPB41P11171 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPB41P11171 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPB41P11171 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPB41P11171 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPB41P11171 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EPB41P11171 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPB41P11171 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPB41P11171 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPB41P11171 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPB41P11171 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPB41P11171 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EPB41P11171 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPB41P11171 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EPB41P11171 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPB41P11171 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPB41P11171 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPB41P11171 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPB41P11171 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPB41P11171 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPB41P11171 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPB41P11171 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPB41P11171 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPB41P11171 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPB41P11171 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB41P11171 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB41P11171 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB41P11171 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB41P11171 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB41P11171 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB41P11171 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB41P11171 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB41P11171 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB41P11171 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB41P11171 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB41P11171 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EPB41P11171 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EPB41P11171 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EPB41P11171 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB41P11171 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB41P11171 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB41P11171 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB41P11171 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB41P11171 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB41P11171 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB41P11171 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB41P11171 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB41P11171 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB41P11171 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB41P11171 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB41P11171 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB41P11171 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB41P11171 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB41P11171 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB41P11171 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41P11171 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41P11171 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41P11171 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41P11171 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41P11171 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41P11171 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41P11171 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41P11171 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41P11171 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41P11171 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41P11171 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41P11171 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41P11171 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41P11171 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41P11171 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41P11171 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41P11171 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41P11171 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41P11171 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41P11171 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41P11171 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41P11171 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41P11171 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41P11171 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41P11171 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41P11171 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41P11171 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41P11171 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41P11171 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41P11171 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41P11171 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41P11171 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41P11171 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41P11171 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41P11171 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB41P11171 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB41P11171 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB41P11171 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB41P11171 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB41P11171 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms