Protein–RNA interactions for Protein: P10745

RBP3, Retinol-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP3P10745 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBP3P10745 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBP3P10745 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBP3P10745 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBP3P10745 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBP3P10745 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBP3P10745 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RBP3P10745 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBP3P10745 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RBP3P10745 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBP3P10745 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBP3P10745 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBP3P10745 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBP3P10745 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBP3P10745 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBP3P10745 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBP3P10745 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBP3P10745 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBP3P10745 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBP3P10745 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBP3P10745 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBP3P10745 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBP3P10745 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBP3P10745 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBP3P10745 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP3P10745 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP3P10745 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP3P10745 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP3P10745 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP3P10745 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP3P10745 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP3P10745 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP3P10745 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP3P10745 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP3P10745 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBP3P10745 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBP3P10745 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBP3P10745 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBP3P10745 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBP3P10745 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBP3P10745 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBP3P10745 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBP3P10745 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RBP3P10745 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBP3P10745 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP3P10745 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP3P10745 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP3P10745 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP3P10745 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP3P10745 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP3P10745 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP3P10745 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP3P10745 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP3P10745 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP3P10745 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP3P10745 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP3P10745 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP3P10745 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP3P10745 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBP3P10745 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBP3P10745 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBP3P10745 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RBP3P10745 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBP3P10745 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBP3P10745 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RBP3P10745 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBP3P10745 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RBP3P10745 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBP3P10745 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP3P10745 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP3P10745 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP3P10745 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP3P10745 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP3P10745 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP3P10745 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP3P10745 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP3P10745 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP3P10745 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP3P10745 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP3P10745 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP3P10745 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP3P10745 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP3P10745 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP3P10745 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP3P10745 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP3P10745 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP3P10745 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP3P10745 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP3P10745 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP3P10745 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP3P10745 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP3P10745 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP3P10745 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP3P10745 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP3P10745 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP3P10745 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP3P10745 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP3P10745 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP3P10745 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP3P10745 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms