Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMIGD3P0DMS9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms