Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GLI1P08151 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GLI1P08151 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GLI1P08151 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GLI1P08151 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GLI1P08151 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GLI1P08151 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GLI1P08151 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GLI1P08151 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GLI1P08151 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GLI1P08151 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GLI1P08151 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GLI1P08151 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GLI1P08151 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GLI1P08151 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GLI1P08151 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GLI1P08151 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GLI1P08151 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GLI1P08151 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI1P08151 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI1P08151 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI1P08151 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI1P08151 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI1P08151 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI1P08151 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI1P08151 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI1P08151 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI1P08151 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI1P08151 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI1P08151 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI1P08151 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI1P08151 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI1P08151 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI1P08151 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI1P08151 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLI1P08151 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GLI1P08151 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLI1P08151 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLI1P08151 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLI1P08151 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLI1P08151 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLI1P08151 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLI1P08151 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLI1P08151 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI1P08151 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI1P08151 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI1P08151 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI1P08151 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI1P08151 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI1P08151 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI1P08151 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI1P08151 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI1P08151 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI1P08151 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI1P08151 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI1P08151 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI1P08151 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI1P08151 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI1P08151 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLI1P08151 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLI1P08151 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLI1P08151 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLI1P08151 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLI1P08151 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLI1P08151 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLI1P08151 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLI1P08151 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLI1P08151 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLI1P08151 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLI1P08151 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLI1P08151 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLI1P08151 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLI1P08151 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLI1P08151 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLI1P08151 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLI1P08151 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLI1P08151 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLI1P08151 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLI1P08151 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLI1P08151 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLI1P08151 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLI1P08151 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLI1P08151 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GLI1P08151 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GLI1P08151 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GLI1P08151 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GLI1P08151 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GLI1P08151 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GLI1P08151 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLI1P08151 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLI1P08151 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLI1P08151 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLI1P08151 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLI1P08151 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLI1P08151 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GLI1P08151 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLI1P08151 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLI1P08151 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLI1P08151 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLI1P08151 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms