Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLBP06746 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLBP06746 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLBP06746 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLBP06746 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLBP06746 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLBP06746 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLBP06746 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLBP06746 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLBP06746 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLBP06746 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLBP06746 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLBP06746 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLBP06746 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POLBP06746 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLBP06746 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLBP06746 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLBP06746 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POLBP06746 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLBP06746 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLBP06746 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLBP06746 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLBP06746 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLBP06746 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLBP06746 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLBP06746 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POLBP06746 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLBP06746 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLBP06746 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLBP06746 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLBP06746 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLBP06746 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLBP06746 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLBP06746 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLBP06746 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLBP06746 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLBP06746 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLBP06746 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLBP06746 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLBP06746 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLBP06746 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLBP06746 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLBP06746 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLBP06746 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLBP06746 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLBP06746 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLBP06746 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLBP06746 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLBP06746 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLBP06746 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLBP06746 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLBP06746 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLBP06746 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLBP06746 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLBP06746 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLBP06746 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLBP06746 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLBP06746 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLBP06746 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLBP06746 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLBP06746 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLBP06746 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLBP06746 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLBP06746 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLBP06746 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLBP06746 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLBP06746 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLBP06746 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLBP06746 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLBP06746 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLBP06746 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLBP06746 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLBP06746 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLBP06746 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLBP06746 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLBP06746 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLBP06746 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLBP06746 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLBP06746 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLBP06746 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLBP06746 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLBP06746 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLBP06746 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLBP06746 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLBP06746 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLBP06746 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLBP06746 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLBP06746 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLBP06746 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLBP06746 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLBP06746 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLBP06746 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLBP06746 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLBP06746 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLBP06746 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLBP06746 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLBP06746 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLBP06746 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLBP06746 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLBP06746 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms