Protein–RNA interactions for Protein: P05538

HLA-DQB2, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB2P05538 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DQB2P05538 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DQB2P05538 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DQB2P05538 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DQB2P05538 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DQB2P05538 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DQB2P05538 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HLA-DQB2P05538 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DQB2P05538 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms