Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCGP05129 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms