Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRM2P04554 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRM2P04554 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRM2P04554 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRM2P04554 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRM2P04554 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRM2P04554 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRM2P04554 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRM2P04554 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRM2P04554 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRM2P04554 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRM2P04554 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRM2P04554 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRM2P04554 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRM2P04554 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRM2P04554 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRM2P04554 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRM2P04554 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRM2P04554 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRM2P04554 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRM2P04554 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRM2P04554 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRM2P04554 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRM2P04554 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRM2P04554 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRM2P04554 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRM2P04554 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRM2P04554 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRM2P04554 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRM2P04554 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRM2P04554 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRM2P04554 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRM2P04554 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRM2P04554 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRM2P04554 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRM2P04554 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRM2P04554 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRM2P04554 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRM2P04554 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRM2P04554 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRM2P04554 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRM2P04554 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRM2P04554 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRM2P04554 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRM2P04554 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRM2P04554 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRM2P04554 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRM2P04554 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRM2P04554 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRM2P04554 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRM2P04554 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRM2P04554 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRM2P04554 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRM2P04554 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRM2P04554 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRM2P04554 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRM2P04554 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRM2P04554 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRM2P04554 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRM2P04554 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRM2P04554 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRM2P04554 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRM2P04554 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRM2P04554 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRM2P04554 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRM2P04554 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRM2P04554 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRM2P04554 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRM2P04554 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRM2P04554 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRM2P04554 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRM2P04554 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRM2P04554 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRM2P04554 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRM2P04554 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRM2P04554 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRM2P04554 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRM2P04554 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRM2P04554 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRM2P04554 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRM2P04554 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRM2P04554 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRM2P04554 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRM2P04554 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRM2P04554 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRM2P04554 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRM2P04554 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRM2P04554 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRM2P04554 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRM2P04554 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRM2P04554 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRM2P04554 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRM2P04554 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRM2P04554 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRM2P04554 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRM2P04554 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRM2P04554 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRM2P04554 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRM2P04554 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRM2P04554 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms