Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNB1P01574 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms