Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms