Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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TSPAN13O95857 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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TSPAN13O95857 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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TSPAN13O95857 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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TSPAN13O95857 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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