Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POP4O95707 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POP4O95707 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POP4O95707 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POP4O95707 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POP4O95707 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POP4O95707 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POP4O95707 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POP4O95707 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POP4O95707 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POP4O95707 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POP4O95707 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POP4O95707 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POP4O95707 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POP4O95707 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POP4O95707 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POP4O95707 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POP4O95707 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POP4O95707 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POP4O95707 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POP4O95707 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POP4O95707 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POP4O95707 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POP4O95707 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POP4O95707 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POP4O95707 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POP4O95707 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POP4O95707 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP4O95707 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP4O95707 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP4O95707 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP4O95707 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP4O95707 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP4O95707 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP4O95707 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP4O95707 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP4O95707 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP4O95707 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP4O95707 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP4O95707 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP4O95707 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP4O95707 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP4O95707 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP4O95707 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP4O95707 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POP4O95707 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POP4O95707 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POP4O95707 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POP4O95707 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POP4O95707 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POP4O95707 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POP4O95707 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POP4O95707 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POP4O95707 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POP4O95707 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POP4O95707 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POP4O95707 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POP4O95707 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POP4O95707 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POP4O95707 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POP4O95707 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POP4O95707 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POP4O95707 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POP4O95707 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POP4O95707 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POP4O95707 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POP4O95707 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POP4O95707 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POP4O95707 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POP4O95707 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POP4O95707 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POP4O95707 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POP4O95707 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POP4O95707 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POP4O95707 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POP4O95707 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POP4O95707 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POP4O95707 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POP4O95707 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POP4O95707 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POP4O95707 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POP4O95707 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POP4O95707 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POP4O95707 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POP4O95707 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POP4O95707 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
POP4O95707 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POP4O95707 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POP4O95707 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POP4O95707 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POP4O95707 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POP4O95707 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POP4O95707 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POP4O95707 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POP4O95707 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POP4O95707 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POP4O95707 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POP4O95707 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POP4O95707 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POP4O95707 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms