Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF6BO95407 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms