Protein–RNA interactions for Protein: O95389

WISP3, WNT1-inducible-signaling pathway protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WISP3O95389 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
WISP3O95389 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
WISP3O95389 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
WISP3O95389 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
WISP3O95389 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
WISP3O95389 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
WISP3O95389 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
WISP3O95389 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
WISP3O95389 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
WISP3O95389 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
WISP3O95389 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
WISP3O95389 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
WISP3O95389 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
WISP3O95389 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
WISP3O95389 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
WISP3O95389 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
WISP3O95389 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
WISP3O95389 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
WISP3O95389 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
WISP3O95389 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
WISP3O95389 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
WISP3O95389 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
WISP3O95389 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WISP3O95389 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
WISP3O95389 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WISP3O95389 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
WISP3O95389 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WISP3O95389 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WISP3O95389 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
WISP3O95389 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WISP3O95389 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
WISP3O95389 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
WISP3O95389 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
WISP3O95389 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
WISP3O95389 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
WISP3O95389 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
WISP3O95389 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
WISP3O95389 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
WISP3O95389 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
WISP3O95389 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
WISP3O95389 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
WISP3O95389 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
WISP3O95389 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
WISP3O95389 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
WISP3O95389 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
WISP3O95389 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
WISP3O95389 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
WISP3O95389 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
WISP3O95389 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
WISP3O95389 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
WISP3O95389 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
WISP3O95389 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
WISP3O95389 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
WISP3O95389 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
WISP3O95389 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
WISP3O95389 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
WISP3O95389 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
WISP3O95389 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
WISP3O95389 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
WISP3O95389 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
WISP3O95389 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
WISP3O95389 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
WISP3O95389 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
WISP3O95389 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
WISP3O95389 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
WISP3O95389 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
WISP3O95389 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
WISP3O95389 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
WISP3O95389 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
WISP3O95389 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
WISP3O95389 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
WISP3O95389 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
WISP3O95389 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
WISP3O95389 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
WISP3O95389 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
WISP3O95389 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
WISP3O95389 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
WISP3O95389 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
WISP3O95389 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
WISP3O95389 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WISP3O95389 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WISP3O95389 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
WISP3O95389 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WISP3O95389 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
WISP3O95389 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WISP3O95389 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WISP3O95389 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WISP3O95389 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
WISP3O95389 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
WISP3O95389 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WISP3O95389 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
WISP3O95389 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WISP3O95389 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
WISP3O95389 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WISP3O95389 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WISP3O95389 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WISP3O95389 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WISP3O95389 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
WISP3O95389 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WISP3O95389 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms