Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSTN1O94985 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms