Protein–RNA interactions for Protein: O94782

USP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP1O94782 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP1O94782 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP1O94782 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP1O94782 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP1O94782 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP1O94782 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP1O94782 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP1O94782 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP1O94782 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP1O94782 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP1O94782 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP1O94782 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP1O94782 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP1O94782 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP1O94782 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP1O94782 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP1O94782 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP1O94782 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP1O94782 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP1O94782 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP1O94782 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP1O94782 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP1O94782 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP1O94782 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP1O94782 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP1O94782 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP1O94782 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP1O94782 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP1O94782 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP1O94782 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP1O94782 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP1O94782 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP1O94782 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP1O94782 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP1O94782 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP1O94782 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP1O94782 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP1O94782 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP1O94782 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP1O94782 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP1O94782 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP1O94782 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP1O94782 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP1O94782 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP1O94782 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP1O94782 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP1O94782 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP1O94782 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP1O94782 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP1O94782 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP1O94782 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP1O94782 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP1O94782 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP1O94782 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP1O94782 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP1O94782 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP1O94782 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP1O94782 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP1O94782 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP1O94782 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP1O94782 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP1O94782 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP1O94782 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP1O94782 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP1O94782 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP1O94782 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP1O94782 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP1O94782 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP1O94782 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP1O94782 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP1O94782 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP1O94782 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP1O94782 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP1O94782 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP1O94782 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP1O94782 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP1O94782 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP1O94782 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP1O94782 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP1O94782 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP1O94782 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP1O94782 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP1O94782 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP1O94782 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP1O94782 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP1O94782 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USP1O94782 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP1O94782 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP1O94782 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP1O94782 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP1O94782 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP1O94782 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP1O94782 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USP1O94782 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP1O94782 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP1O94782 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP1O94782 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP1O94782 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP1O94782 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP1O94782 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms