Protein–RNA interactions for Protein: O76013

KRT36, Keratin, type I cuticular Ha6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT36O76013 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT36O76013 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KRT36O76013 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT36O76013 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT36O76013 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT36O76013 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT36O76013 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT36O76013 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT36O76013 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT36O76013 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT36O76013 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT36O76013 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT36O76013 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT36O76013 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT36O76013 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT36O76013 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT36O76013 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT36O76013 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT36O76013 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT36O76013 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT36O76013 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT36O76013 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT36O76013 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT36O76013 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT36O76013 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT36O76013 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT36O76013 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT36O76013 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT36O76013 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT36O76013 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT36O76013 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT36O76013 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT36O76013 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT36O76013 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT36O76013 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT36O76013 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT36O76013 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT36O76013 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT36O76013 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT36O76013 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT36O76013 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT36O76013 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT36O76013 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT36O76013 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT36O76013 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT36O76013 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT36O76013 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT36O76013 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT36O76013 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT36O76013 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT36O76013 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT36O76013 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT36O76013 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT36O76013 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT36O76013 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT36O76013 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT36O76013 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT36O76013 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT36O76013 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT36O76013 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT36O76013 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT36O76013 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT36O76013 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT36O76013 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT36O76013 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT36O76013 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT36O76013 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT36O76013 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT36O76013 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
KRT36O76013 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT36O76013 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT36O76013 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT36O76013 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT36O76013 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT36O76013 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT36O76013 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT36O76013 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT36O76013 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT36O76013 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT36O76013 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT36O76013 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT36O76013 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT36O76013 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT36O76013 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT36O76013 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT36O76013 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT36O76013 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT36O76013 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT36O76013 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT36O76013 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT36O76013 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT36O76013 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT36O76013 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT36O76013 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT36O76013 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT36O76013 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT36O76013 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT36O76013 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT36O76013 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT36O76013 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms