Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF3JO75822 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF3JO75822 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF3JO75822 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF3JO75822 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF3JO75822 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF3JO75822 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF3JO75822 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF3JO75822 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF3JO75822 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF3JO75822 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF3JO75822 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF3JO75822 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF3JO75822 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF3JO75822 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF3JO75822 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF3JO75822 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF3JO75822 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF3JO75822 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF3JO75822 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms