Protein–RNA interactions for Protein: O75818

RPP40, Ribonuclease P protein subunit p40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPP40O75818 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPP40O75818 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPP40O75818 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RPP40O75818 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPP40O75818 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPP40O75818 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPP40O75818 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPP40O75818 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPP40O75818 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPP40O75818 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPP40O75818 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPP40O75818 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPP40O75818 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPP40O75818 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPP40O75818 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPP40O75818 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPP40O75818 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPP40O75818 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPP40O75818 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPP40O75818 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPP40O75818 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPP40O75818 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPP40O75818 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPP40O75818 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPP40O75818 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPP40O75818 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPP40O75818 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPP40O75818 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPP40O75818 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPP40O75818 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPP40O75818 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPP40O75818 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPP40O75818 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPP40O75818 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPP40O75818 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPP40O75818 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPP40O75818 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPP40O75818 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPP40O75818 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPP40O75818 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPP40O75818 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPP40O75818 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPP40O75818 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPP40O75818 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPP40O75818 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPP40O75818 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPP40O75818 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPP40O75818 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPP40O75818 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPP40O75818 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPP40O75818 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPP40O75818 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPP40O75818 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RPP40O75818 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RPP40O75818 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RPP40O75818 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RPP40O75818 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPP40O75818 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPP40O75818 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPP40O75818 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPP40O75818 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPP40O75818 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPP40O75818 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPP40O75818 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPP40O75818 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPP40O75818 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RPP40O75818 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPP40O75818 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPP40O75818 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPP40O75818 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPP40O75818 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPP40O75818 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPP40O75818 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPP40O75818 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPP40O75818 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPP40O75818 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPP40O75818 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPP40O75818 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPP40O75818 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPP40O75818 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPP40O75818 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPP40O75818 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPP40O75818 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPP40O75818 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPP40O75818 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RPP40O75818 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RPP40O75818 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPP40O75818 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RPP40O75818 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPP40O75818 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPP40O75818 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPP40O75818 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPP40O75818 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPP40O75818 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPP40O75818 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPP40O75818 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPP40O75818 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPP40O75818 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPP40O75818 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPP40O75818 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms