Protein–RNA interactions for Protein: O60504

SORBS3, Vinexin, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORBS3O60504 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SORBS3O60504 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SORBS3O60504 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms