Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.212e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 VOPP1-202ENST00000414113 539 ntTSL 411.71□□□□□ -0.532e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 VOPP1-213ENST00000455023 574 ntTSL 411.61□□□□□ -0.552e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 VOPP1-217ENST00000625836 1400 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.682e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 VOPP1-206ENST00000428097 1671 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.712e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 VOPP1-212ENST00000454227 610 ntTSL 4 BASIC9.68□□□□□ -0.862e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 VOPP1-204ENST00000418904 1317 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.862e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 VOPP1-208ENST00000433959 2900 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.892e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 VOPP1-211ENST00000453256 649 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.112e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 VOPP1-203ENST00000417399 591 ntTSL 47.67□□□□□ -1.182e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 VOPP1-205ENST00000427700 632 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.332e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.131e-8■■■■■ 29.5
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RBFOX2O43251 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.281e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 TMEM135-204ENST00000526733 496 ntTSL 213.21□□□□□ -0.295e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.361e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 TASP1-206ENST00000480436 2302 ntTSL 512.45□□□□□ -0.421e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.521e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 SNX6-205ENST00000555648 467 ntTSL 311.73□□□□□ -0.531e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.541e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.541e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.551e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.571e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.61e-8■■■■■ 29.5
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RBFOX2O43251 SNX6-203ENST00000555416 1215 ntTSL 1 (best)10.54□□□□□ -0.721e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 TASP1-204ENST00000465381 993 ntTSL 510.46□□□□□ -0.731e-8■■■■■ 29.5
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RBFOX2O43251 SNX6-207ENST00000556303 539 ntTSL 29.66□□□□□ -0.861e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 DMAC2-206ENST00000589102 541 ntTSL 49.54□□□□□ -0.881e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 DMAC2-211ENST00000594339 782 ntTSL 29.44□□□□□ -0.91e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 ZWILCH-202ENST00000446801 3256 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.931e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 ZWILCH-214ENST00000613446 3181 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.951e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 SNX6-209ENST00000557265 725 ntTSL 38.99□□□□□ -0.971e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 SNX6-201ENST00000362031 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.041e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 ZWILCH-201ENST00000307897 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.051e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 DMAC2-214ENST00000595425 572 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.121e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 SNX6-208ENST00000556712 851 ntTSL 57.99□□□□□ -1.131e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 DMAC2-213ENST00000595407 527 ntTSL 27.88□□□□□ -1.151e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 DMAC2-209ENST00000590641 1026 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.181e-8■■■■■ 29.5
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RBFOX2O43251 CENPJ-201ENST00000381884 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.483e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.523e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 TMEM135-206ENST00000529023 1095 ntTSL 24.63□□□□□ -1.675e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 CENPJ-202ENST00000418179 691 ntTSL 1 (best)3.21□□□□□ -1.93e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.913e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 TMEM135-208ENST00000531800 201 ntTSL 51.7□□□□□ -2.145e-8■■■■■ 29.5
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RBFOX2O43251 TCF25-206ENST00000562193 627 ntTSL 38.08□□□□□ -1.125e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 LRRFIP1-205ENST00000420665 570 ntTSL 318.74■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 29.5
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RBFOX2O43251 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.461e-6■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 LRRFIP1-209ENST00000473815 476 ntTSL 39.71□□□□□ -0.861e-6■■■■■ 29.5
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RBFOX2O43251 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.122e-9■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.189e-8■■■■■ 29.5
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RBFOX2O43251 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.353e-7■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 SAMD1-201ENST00000269724 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.07■□□□□ 03e-7■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 SPPL2B-204ENST00000587851 586 ntTSL 316.75■□□□□ 0.277e-7■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.565e-6■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.245e-6■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.25e-6■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 ATP2C1-217ENST00000509662 559 ntTSL 418.54■□□□□ 0.562e-8■■■■■ 29.4
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RBFOX2O43251 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.342e-8■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.292e-8■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 CCM2-203ENST00000461377 1983 ntTSL 516.71■□□□□ 0.275e-6■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 FAM120A-203ENST00000427765 1710 ntTSL 1 (best)16.59■□□□□ 0.252e-8■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.155e-6■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 CCM2-216ENST00000488727 1719 ntTSL 515.52■□□□□ 0.085e-6■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.032e-8■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -02e-8■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.025e-6■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 CRYM-AS1-203ENST00000561968 559 ntTSL 514.91□□□□□ -0.021e-12■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.032e-8■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 NSUN5-206ENST00000471461 2286 ntTSL 214.72□□□□□ -0.052e-8■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.112e-8■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 NACC1-203ENST00000586171 534 ntTSL 514.15□□□□□ -0.149e-8■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.262e-8■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.311e-12■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.322e-8■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 NBAS-202ENST00000417461 1330 ntTSL 213.01□□□□□ -0.332e-8■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.332e-8■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 NSUN5-205ENST00000455763 471 ntTSL 412.76□□□□□ -0.372e-8■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.389e-8■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 NBAS-209ENST00000485694 1798 ntTSL 212.58□□□□□ -0.392e-8■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.452e-8■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.562e-8■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 ATP2C1-221ENST00000513801 3439 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.72e-8■■■■■ 29.4
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