Protein–RNA interactions for Protein: O43174

CYP26A1, Cytochrome P450 26A1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26A1O43174 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYP26A1O43174 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYP26A1O43174 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYP26A1O43174 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYP26A1O43174 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYP26A1O43174 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYP26A1O43174 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP26A1O43174 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP26A1O43174 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP26A1O43174 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP26A1O43174 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP26A1O43174 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP26A1O43174 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP26A1O43174 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP26A1O43174 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP26A1O43174 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP26A1O43174 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP26A1O43174 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP26A1O43174 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP26A1O43174 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP26A1O43174 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CYP26A1O43174 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP26A1O43174 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms