Protein–RNA interactions for Protein: O15212

PFDN6, Prefoldin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN6O15212 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PFDN6O15212 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms