Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1CO15160 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1CO15160 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1CO15160 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1CO15160 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1CO15160 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.28■■□□□ 1
POLR1CO15160 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1CO15160 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1CO15160 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1CO15160 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1CO15160 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1CO15160 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1CO15160 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1CO15160 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1CO15160 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1CO15160 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1CO15160 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1CO15160 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1CO15160 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1CO15160 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1CO15160 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms