Protein–RNA interactions for Protein: O14910

LIN7A, Protein lin-7 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN7AO14910 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN7AO14910 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN7AO14910 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN7AO14910 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN7AO14910 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN7AO14910 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN7AO14910 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN7AO14910 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LIN7AO14910 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIN7AO14910 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIN7AO14910 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIN7AO14910 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIN7AO14910 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIN7AO14910 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIN7AO14910 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIN7AO14910 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIN7AO14910 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIN7AO14910 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIN7AO14910 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIN7AO14910 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIN7AO14910 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIN7AO14910 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN7AO14910 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN7AO14910 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN7AO14910 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN7AO14910 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN7AO14910 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN7AO14910 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN7AO14910 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN7AO14910 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN7AO14910 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN7AO14910 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN7AO14910 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN7AO14910 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN7AO14910 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms