Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
APAF1O14727 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
APAF1O14727 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
APAF1O14727 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
APAF1O14727 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
APAF1O14727 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
APAF1O14727 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
APAF1O14727 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
APAF1O14727 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
APAF1O14727 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
APAF1O14727 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
APAF1O14727 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
APAF1O14727 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
APAF1O14727 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
APAF1O14727 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
APAF1O14727 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
APAF1O14727 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
APAF1O14727 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
APAF1O14727 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
APAF1O14727 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
APAF1O14727 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
APAF1O14727 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
APAF1O14727 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
APAF1O14727 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
APAF1O14727 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
APAF1O14727 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
APAF1O14727 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
APAF1O14727 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
APAF1O14727 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
APAF1O14727 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
APAF1O14727 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
APAF1O14727 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
APAF1O14727 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
APAF1O14727 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
APAF1O14727 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
APAF1O14727 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
APAF1O14727 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
APAF1O14727 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
APAF1O14727 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
APAF1O14727 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
APAF1O14727 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
APAF1O14727 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
APAF1O14727 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
APAF1O14727 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
APAF1O14727 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
APAF1O14727 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
APAF1O14727 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
APAF1O14727 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
APAF1O14727 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
APAF1O14727 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
APAF1O14727 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
APAF1O14727 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
APAF1O14727 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
APAF1O14727 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
APAF1O14727 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
APAF1O14727 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
APAF1O14727 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
APAF1O14727 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
APAF1O14727 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
APAF1O14727 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
APAF1O14727 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
APAF1O14727 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
APAF1O14727 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
APAF1O14727 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
APAF1O14727 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
APAF1O14727 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
APAF1O14727 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
APAF1O14727 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
APAF1O14727 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
APAF1O14727 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
APAF1O14727 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
APAF1O14727 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
APAF1O14727 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
APAF1O14727 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
APAF1O14727 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
APAF1O14727 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
APAF1O14727 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
APAF1O14727 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
APAF1O14727 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
APAF1O14727 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
APAF1O14727 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
APAF1O14727 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
APAF1O14727 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
APAF1O14727 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
APAF1O14727 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
APAF1O14727 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
APAF1O14727 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
APAF1O14727 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
APAF1O14727 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
APAF1O14727 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
APAF1O14727 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
APAF1O14727 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
APAF1O14727 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
APAF1O14727 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
APAF1O14727 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
APAF1O14727 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
APAF1O14727 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
APAF1O14727 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
APAF1O14727 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
APAF1O14727 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms