Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F3O00716 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F3O00716 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F3O00716 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F3O00716 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F3O00716 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F3O00716 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F3O00716 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F3O00716 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F3O00716 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F3O00716 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F3O00716 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F3O00716 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F3O00716 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F3O00716 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F3O00716 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F3O00716 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F3O00716 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F3O00716 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F3O00716 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F3O00716 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F3O00716 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F3O00716 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F3O00716 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F3O00716 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F3O00716 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F3O00716 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F3O00716 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F3O00716 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F3O00716 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F3O00716 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F3O00716 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F3O00716 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F3O00716 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F3O00716 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F3O00716 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F3O00716 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F3O00716 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F3O00716 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F3O00716 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F3O00716 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F3O00716 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F3O00716 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F3O00716 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
E2F3O00716 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
E2F3O00716 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
E2F3O00716 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
E2F3O00716 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
E2F3O00716 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F3O00716 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F3O00716 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F3O00716 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F3O00716 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F3O00716 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F3O00716 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F3O00716 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F3O00716 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F3O00716 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F3O00716 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F3O00716 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F3O00716 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F3O00716 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F3O00716 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F3O00716 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F3O00716 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F3O00716 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F3O00716 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F3O00716 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F3O00716 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F3O00716 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F3O00716 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F3O00716 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F3O00716 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F3O00716 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F3O00716 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F3O00716 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F3O00716 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F3O00716 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F3O00716 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F3O00716 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F3O00716 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F3O00716 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F3O00716 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F3O00716 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F3O00716 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F3O00716 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F3O00716 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F3O00716 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F3O00716 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F3O00716 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F3O00716 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F3O00716 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F3O00716 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F3O00716 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F3O00716 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F3O00716 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F3O00716 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F3O00716 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F3O00716 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F3O00716 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms