Protein–RNA interactions for Protein: O00501

CLDN5, Claudin-5, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5O00501 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN5O00501 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN5O00501 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN5O00501 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN5O00501 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN5O00501 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN5O00501 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN5O00501 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN5O00501 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN5O00501 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN5O00501 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN5O00501 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN5O00501 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN5O00501 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN5O00501 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN5O00501 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN5O00501 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN5O00501 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN5O00501 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN5O00501 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN5O00501 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN5O00501 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN5O00501 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN5O00501 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN5O00501 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN5O00501 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN5O00501 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN5O00501 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN5O00501 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN5O00501 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms