Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MEIS1O00470 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MEIS1O00470 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms