Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
J3KT08 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3KT08 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3KT08 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3KT08 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3KT08 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3KT08 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3KT08 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3KT08 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
J3KT08 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
J3KT08 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
J3KT08 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
J3KT08 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
J3KT08 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
J3KT08 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
J3KT08 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
J3KT08 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
J3KT08 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
J3KT08 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
J3KT08 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
J3KT08 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
J3KT08 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
J3KT08 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
J3KT08 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
J3KT08 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
J3KT08 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
J3KT08 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
J3KT08 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
J3KT08 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
J3KT08 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
J3KT08 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
J3KT08 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
J3KT08 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
J3KT08 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
J3KT08 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
J3KT08 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
J3KT08 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
J3KT08 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
J3KT08 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
J3KT08 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
J3KT08 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
J3KT08 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
J3KT08 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
J3KT08 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
J3KT08 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
J3KT08 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
J3KT08 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
J3KT08 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
J3KT08 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
J3KT08 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
J3KT08 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
J3KT08 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
J3KT08 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
J3KT08 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
J3KT08 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
J3KT08 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
J3KT08 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
J3KT08 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
J3KT08 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
J3KT08 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
J3KT08 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
J3KT08 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
J3KT08 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
J3KT08 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
J3KT08 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
J3KT08 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
J3KT08 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
J3KT08 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
J3KT08 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
J3KT08 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
J3KT08 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
J3KT08 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
J3KT08 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
J3KT08 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
J3KT08 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
J3KT08 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
J3KT08 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
J3KT08 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
J3KT08 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
J3KT08 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
J3KT08 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
J3KT08 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
J3KT08 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
J3KT08 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
J3KT08 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
J3KT08 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
J3KT08 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
J3KT08 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
J3KT08 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
J3KT08 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
J3KT08 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
J3KT08 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
J3KT08 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
J3KT08 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
J3KT08 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
J3KT08 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
J3KT08 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
J3KT08 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
J3KT08 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
J3KT08 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms