Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
H7C1W4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
H7C1W4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
H7C1W4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
H7C1W4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
H7C1W4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
H7C1W4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
H7C1W4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
H7C1W4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
H7C1W4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
H7C1W4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
H7C1W4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
H7C1W4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
H7C1W4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
H7C1W4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
H7C1W4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
H7C1W4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
H7C1W4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
H7C1W4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
H7C1W4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
H7C1W4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
H7C1W4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
H7C1W4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
H7C1W4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
H7C1W4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
H7C1W4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
H7C1W4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
H7C1W4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
H7C1W4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
H7C1W4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
H7C1W4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
H7C1W4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
H7C1W4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
H7C1W4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
H7C1W4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
H7C1W4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
H7C1W4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
H7C1W4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
H7C1W4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
H7C1W4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
H7C1W4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
H7C1W4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
H7C1W4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
H7C1W4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
H7C1W4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
H7C1W4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
H7C1W4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
H7C1W4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
H7C1W4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
H7C1W4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
H7C1W4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
H7C1W4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
H7C1W4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
H7C1W4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
H7C1W4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
H7C1W4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
H7C1W4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
H7C1W4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
H7C1W4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
H7C1W4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
H7C1W4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
H7C1W4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
H7C1W4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
H7C1W4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
H7C1W4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
H7C1W4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
H7C1W4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
H7C1W4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
H7C1W4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
H7C1W4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
H7C1W4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
H7C1W4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
H7C1W4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
H7C1W4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
H7C1W4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
H7C1W4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
H7C1W4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
H7C1W4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
H7C1W4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
H7C1W4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
H7C1W4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
H7C1W4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
H7C1W4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
H7C1W4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
H7C1W4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
H7C1W4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
H7C1W4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
H7C1W4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
H7C1W4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
H7C1W4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
H7C1W4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
H7C1W4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
H7C1W4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
H7C1W4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
H7C1W4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
H7C1W4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
H7C1W4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
H7C1W4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
H7C1W4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
H7C1W4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms