Protein–RNA interactions for Protein: H3BPM6

MKRN2OS, MKRN2 opposite strand protein, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN2OSH3BPM6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN2OSH3BPM6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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