Protein–RNA interactions for Protein: E9PAV3

NACA, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAE9PAV3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NACAE9PAV3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NACAE9PAV3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms