Protein–RNA interactions for Protein: C9JI98

TMEM238, Transmembrane protein 238, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM238C9JI98 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM238C9JI98 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms