Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms