Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
A8MVJ9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
A8MVJ9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
A8MVJ9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
A8MVJ9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
A8MVJ9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
A8MVJ9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
A8MVJ9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
A8MVJ9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
A8MVJ9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
A8MVJ9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
A8MVJ9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
A8MVJ9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
A8MVJ9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
A8MVJ9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
A8MVJ9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
A8MVJ9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
A8MVJ9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
A8MVJ9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
A8MVJ9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
A8MVJ9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
A8MVJ9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
A8MVJ9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
A8MVJ9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
A8MVJ9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
A8MVJ9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
A8MVJ9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
A8MVJ9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
A8MVJ9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
A8MVJ9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
A8MVJ9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
A8MVJ9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
A8MVJ9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
A8MVJ9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
A8MVJ9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
A8MVJ9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
A8MVJ9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
A8MVJ9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
A8MVJ9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
A8MVJ9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
A8MVJ9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
A8MVJ9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
A8MVJ9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
A8MVJ9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
A8MVJ9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
A8MVJ9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
A8MVJ9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
A8MVJ9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
A8MVJ9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
A8MVJ9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
A8MVJ9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
A8MVJ9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
A8MVJ9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
A8MVJ9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
A8MVJ9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
A8MVJ9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
A8MVJ9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
A8MVJ9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
A8MVJ9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
A8MVJ9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
A8MVJ9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
A8MVJ9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
A8MVJ9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
A8MVJ9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
A8MVJ9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
A8MVJ9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
A8MVJ9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
A8MVJ9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
A8MVJ9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
A8MVJ9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
A8MVJ9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
A8MVJ9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
A8MVJ9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
A8MVJ9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
A8MVJ9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
A8MVJ9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
A8MVJ9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
A8MVJ9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
A8MVJ9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
A8MVJ9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
A8MVJ9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
A8MVJ9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
A8MVJ9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
A8MVJ9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
A8MVJ9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
A8MVJ9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
A8MVJ9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
A8MVJ9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
A8MVJ9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
A8MVJ9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
A8MVJ9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
A8MVJ9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
A8MVJ9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
A8MVJ9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
A8MVJ9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
A8MVJ9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
A8MVJ9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
A8MVJ9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
A8MVJ9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
A8MVJ9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms