Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP27XA6NNY8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms