Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERINC4A6NH21 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172 ms