Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C9orf92A6NGG3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms